หลักสูตรเภสัชศาสตรบัณฑิต (หลักสูตรปรับปรุง พ.ศ. 2566) ได้ปรับปรุงอย่างสอดคล้องกับพันธกิจหลัก 4 ประการของมหาวิทยาลัยศิลปากร ได้แก่ 1) การผลิตบัณฑิต เพื่อพัฒนาศักยภาพทรัพยากรมนุษย์ โดยสร้างประสบการณ์การเรียนรู้ผ่านสภาพแวดล้อมเชิงสร้างสรรค์และการเรียนรู้เชิงนวัตกรรม 2) การวิจัย เพื่อสร้างองค์ความรู้ นวัตกรรม และงานสร้างสรรค์ เพื่อการพัฒนาสังคมอย่างยั่งยืน 3) การให้บริการวิชาการเพื่อเสริมสร้างความเข้มแข็งและความผาสุกแก่สังคม 4) เป็นศูนย์กลางองค์ความรู้ด้านการทำนุบำรุงศิลปวัฒนธรรมของประเทศ ดังปณิธานของมหาวิทยาลัยศิลปากรที่ว่า “สร้างสรรค์ศิลปะ วิทยาการ และภูมิปัญญาเพื่อสังคม” ตามปรัชญาจัดการศึกษาของมหาวิทยาลัยที่เน้นการจัดการศึกษาให้ผู้เรียนเกิดผลสัมฤทธิ์ทางการเรียน โดยบัณฑิตเป็นผู้นำ ผสานศาสตร์และศิลป์ สร้างสรรค์คุณค่าสู่สังคม คณะเภสัชศาสตร์ มหาวิทยาลัยศิลปากร เป็นคณะวิชาชั้นนำแห่งการสร้างสรรค์นวัตกรรมทางสุขภาพ หลักสูตรฯ จึงมุ่งเน้นการผลิตบัณฑิตทางเภสัชศาสตร์ที่มีความเป็นเลิศทางวิชาการ มีคุณธรรมและจริยธรรม ตอบสนองต่อความต้องการของสังคม และเป็นที่ยอมรับในระดับสากล พัฒนางานวิจัย ให้บริการวิชาการสู่ชุมชนและสังคม สร้างรายได้ สร้างเครือข่ายความร่วมมือกับองค์กรทั้งในและต่างประเทศ ทำนุบำรุงศิลปวัฒนธรรม มุ่งสู่ความเป็นองค์กรแห่งปัญญาทางเภสัชศาสตร์ระดับนำของประเทศ ภายใต้การบริหารจัดการองค์กรตามหลักธรรมาภิบาล สอดคล้องกับวิสัยทัศน์ของคณะฯ ที่มุ่งสู่ “องค์กรเป็นเลิศด้านการศึกษาและสร้างสรรค์นวัตกรรมเภสัชศาสตร์แม่นยำ เพื่อสังคมสุขภาวะอย่างยั่งยืน”